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Campo DCValorIdioma
dc.contributor.advisor1Pereira, Rodrigo Matheus-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8155952045293310pt_BR
dc.contributor.referee1Simionatto, Simone-
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4455429740861414pt_BR
dc.contributor.referee2Vilela, Danielle Marques-
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/7752004271710878pt_BR
dc.creatorShirakawa, Karina Tamie-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/3719939043878197pt_BR
dc.date.accessioned2020-09-22T12:39:35Z-
dc.date.available2020-09-22T12:39:35Z-
dc.date.issued2014-12-12-
dc.identifier.citationSHIRAKAWA, Karina Tamie. Análise do transcriptoma de Urochloa decumbens (Stapf) cv. Basilisk para a identificação de peptídeos antimicrobianos. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Biotecnologia) – Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais, Universidade Federal da Grande Dourados, Dourados, MS, 2014.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4147-
dc.description.resumoO objetivo do presente trabalho foi realizar a identificação de peptídeos antimicrobianos no transcriptoma de Urochloa decumbens cv. Basilisk utilizando ferramentas da Bioinformática, classificando os peptídeos antimicrobianos vegetais encontrados em famílias. Este trabalho visa fornecer informações sobre a espécie vegetal em análise e identificar os peptídeos antimicrobianos que possam ser utilizados como princípios ativos de fármacos ou como inseticidas, e em programas de melhoramento genético. O RNA foi extraído pela EMBRAPA Gado de Corte (Campo Grande, MS) e sequenciado pelo Beijing Genomics Institute, na China. O alinhamento dos transcritos únicos da planta foi realizado localmente utilizando o BLASTx pelo script BLASTall contra o banco de dados de peptídeos antimicrobianos CAMP. Os resultados foram organizados e analisados utilizando o MySQL, separando e contabilizando por taxonomia de origem, atividade antimicrobiana e família de peptídeos antimicrobianos. Do alinhamento obteve-se, inicialmente, 3.161 similaridades com 250 peptídeos antimicrobianos diferentes que, após a seleção manual, obteve-se 1.033 similaridades com 94 peptídeos antimicrobianos diferentes entre si. Os peptídeos antimicrobianos resultantes tinham principalmente atividade antibacteriana e antifúngica, pertencendo, principalmente, as famílias: taumatinas, snakins e defensinas, porém a maioria permaneceu como não definida pela classificação do CAMP. Os resultados obtidos demonstraram a diversidade do arsenal de defesa de U. decumbens cv. Basilisk.pt_BR
dc.description.provenanceSubmitted by Alison Souza (alisonsouza@ufgd.edu.br) on 2020-09-22T12:39:35Z No. of bitstreams: 1 KarinaTamieShirakawa.pdf: 1103205 bytes, checksum: 48ded52da99e3aa98d0b3c949cc438bd (MD5)en
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2020-09-22T12:39:35Z (GMT). No. of bitstreams: 1 KarinaTamieShirakawa.pdf: 1103205 bytes, checksum: 48ded52da99e3aa98d0b3c949cc438bd (MD5) Previous issue date: 2014-12-12en
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Pesquisas (CNPq)pt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal da Grande Douradospt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentFaculdade de Ciências Biológicas e Ambientaispt_BR
dc.publisher.initialsUFGDpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectBrachiaria decumbensla
dc.subjectBioinformáticapt_BR
dc.subjectBioinformaticsen
dc.subjectReação de defesa das plantaspt_BR
dc.subjectPlant defense reactionsen
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASpt_BR
dc.titleAnálise do transcriptoma de Urochloa decumbens (Stapf) cv. Basilisk para a identificação de peptídeos antimicrobianospt_BR
dc.typeTrabalho de Conclusão de Cursopt_BR
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