Use este identificador para citar ou linkar para este item: http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4151
Registro completo de metadados
Campo DCValorIdioma
dc.contributor.advisor1Pereira, Rodrigo Matheus-
dc.contributor.advisor1Latteshttp://lattes.cnpq.br/8155952045293310pt_BR
dc.contributor.referee1Grisolia, Alexeia Barufatti-
dc.contributor.referee1Latteshttp://lattes.cnpq.br/4212280532558083pt_BR
dc.contributor.referee2Rezende, Rodrigo Kelson Silva-
dc.contributor.referee2Latteshttp://lattes.cnpq.br/6884029535712574pt_BR
dc.creatorSegatto, Rosana Alessandra-
dc.creator.Latteshttp://lattes.cnpq.br/6966846301705720pt_BR
dc.date.accessioned2020-09-22T12:51:23Z-
dc.date.available2020-09-22T12:51:23Z-
dc.date.issued2014-07-22-
dc.identifier.citationSEGATTO, Rosana Alessandra. Análise de genes de resistência no transcriptoma de Urochloa decumbens cv. basilisk. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Biotecnologia) – Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais, Universidade Federal da Grande Dourados, Dourados, MS, 2014.pt_BR
dc.identifier.urihttp://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4151-
dc.description.resumoAs pastagens ocupam 35% da área territorial do centro-oeste, tendo a pecuária grande importância regional. A Urochloa decumbens cv. Basilisk é uma gramínea forrageira e suas variedades foram responsáveis pela revolução das pastagens na pecuária nacional em 1970. Objetivou-se fazer uma análise dos genes de resistência no transcriptoma de Urochloa decumbens cv. Basilisk através das ferramentas da Bioinformática. Averiguar os domínios de resistência presentes em U. decumbens e construir árvores filogéneticas. Este trabalho tem importância para o conhecimento desta espécie vegetal e levantamento de genes que possam ser usados em programas de melhoramento de resistência em gramíneas. Foram obtidos 164.920 transcritos únicos com a EMBRAPA Gado de Corte em Campo Grande - MS e em seguida foi realizado um alinhamento local dos transcritos únicos contra os genes de resistência do banco de dados PRGdb instalado localmente. Estes resultados foram organizados em um banco de dados usando MySQL, e os domínios de proteínas de resistência foram contados. Então 2% de 1221 genes foram anotados em detalhes por comparações com os bancos de dados Interpro, Non- redundant Protein Data- NR , Genbank–NT, Refseq, Clusters of Orthologoes Grups- COG Gene Ontology-GO, Kioto Encyclopedia of Genes and Genomes-KEGG e Conserved Domains Database- CCD, afim de verificar suas características e funções. Em seguida os mesmos foram usados para uma análise filogenética, utilizando-se os programas Bioedit, Clustal e MEGA 6.06 repectivamente, resultando em árvores filogenéticas. Das 164.920 sequências transcritas por Urochloa decumbens foi possível encontrar 2.445 sequências referentes a genes de resistência em plantas através da comparação com o banco PRGdb. Dos 2.445 genes, 1.221 eram diferentes entre si e podiam ser divididos em 12 domínios e multi-domínios de proteínas de resistência, sendo os domínios mais abundantes a Serina-Treonina-Quinase, NBS-LRR, e Serina-Treonina- Quinase – LRR. Outros domínios encontrados em menor quantidade foram MLO, GNK2, Unknown, Receptor like kinase, NBARC e TIR. As árvores filogenéticas permitiram relacionar os genes de U. decumbens aos de outras espécies conhecidas. Espera-se que este trabalho possa ser de auxílio em programas de melhoramento da Urochloa decumbens e de outras pastagens.pt_BR
dc.description.provenanceSubmitted by Alison Souza (alisonsouza@ufgd.edu.br) on 2020-09-22T12:51:23Z No. of bitstreams: 1 RosanaAlessandraSegatto.pdf: 2239911 bytes, checksum: db1835eda7a061b2fcda8450e297a3ba (MD5)en
dc.description.provenanceMade available in DSpace on 2020-09-22T12:51:23Z (GMT). No. of bitstreams: 1 RosanaAlessandraSegatto.pdf: 2239911 bytes, checksum: db1835eda7a061b2fcda8450e297a3ba (MD5) Previous issue date: 2014-07-22en
dc.description.sponsorshipConselho Nacional de Pesquisas (CNPq)pt_BR
dc.languageporpt_BR
dc.publisherUniversidade Federal da Grande Douradospt_BR
dc.publisher.countryBrasilpt_BR
dc.publisher.departmentFaculdade de Ciências Biológicas e Ambientaispt_BR
dc.publisher.initialsUFGDpt_BR
dc.rightsAcesso Abertopt_BR
dc.subjectBioinformáticapt_BR
dc.subjectBioinformaticsen
dc.subjectBrachiaria decumbensla
dc.subjectVariação genéticapt_BR
dc.subjectGenetic variationen
dc.subject.cnpqCNPQ::CIENCIAS BIOLOGICASpt_BR
dc.titleAnálise de genes de resistência no transcriptoma de Urochloa decumbens cv. basiliskpt_BR
dc.typeTrabalho de Conclusão de Cursopt_BR
Aparece nas coleções:Biotecnologia

Arquivos associados a este item:
Arquivo Descrição TamanhoFormato 
RosanaAlessandraSegatto.pdf2,19 MBAdobe PDFVisualizar/Abrir
Mostrar registro simples do item Recomendar este item Visualizar estatísticas


Os itens no repositório estão protegidos por copyright, com todos os direitos reservados, salvo quando é indicado o contrário.