Tipo:	Trabalho de Conclusão de Curso
Título:	Análise do transcriptoma de Urochloa decumbens (Stapf) cv. Basilisk para a identificação de peptídeos antimicrobianos
Autor(es):	Shirakawa, Karina Tamie
Primeiro Orientador:	Pereira, Rodrigo Matheus
metadata.dc.contributor.referee1:	Simionatto, Simone
metadata.dc.contributor.referee2:	Vilela, Danielle Marques
Resumo:	O objetivo do presente trabalho foi realizar a identificação de peptídeos antimicrobianos no transcriptoma de Urochloa decumbens cv. Basilisk utilizando ferramentas da Bioinformática, classificando os peptídeos antimicrobianos vegetais encontrados em famílias. Este trabalho visa fornecer informações sobre a espécie vegetal em análise e identificar os peptídeos antimicrobianos que possam ser utilizados como princípios ativos de fármacos ou como inseticidas, e em programas de melhoramento genético. O RNA foi extraído pela EMBRAPA Gado de Corte (Campo Grande, MS) e sequenciado pelo Beijing Genomics Institute, na China. O alinhamento dos transcritos únicos da planta foi realizado localmente utilizando o BLASTx pelo script BLASTall contra o banco de dados de peptídeos antimicrobianos CAMP. Os resultados foram organizados e analisados utilizando o MySQL, separando e contabilizando por taxonomia de origem, atividade antimicrobiana e família de peptídeos antimicrobianos. Do alinhamento obteve-se, inicialmente, 3.161 similaridades com 250 peptídeos antimicrobianos diferentes que, após a seleção manual, obteve-se 1.033 similaridades com 94 peptídeos antimicrobianos diferentes entre si. Os peptídeos antimicrobianos resultantes tinham principalmente atividade antibacteriana e antifúngica, pertencendo, principalmente, as famílias: taumatinas, snakins e defensinas, porém a maioria permaneceu como não definida pela classificação do CAMP. Os resultados obtidos demonstraram a diversidade do arsenal de defesa de U. decumbens cv. Basilisk.
Palavras-chave:	Brachiaria decumbens Bioinformática Bioinformatics Reação de defesa das plantas Plant defense reactions
CNPq:	CNPQ::CIENCIAS BIOLOGICAS
Idioma:	por
País:	Brasil
Editor:	Universidade Federal da Grande Dourados
Sigla da Instituição:	UFGD
metadata.dc.publisher.department:	Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais
Citação:	SHIRAKAWA, Karina Tamie. Análise do transcriptoma de Urochloa decumbens (Stapf) cv. Basilisk para a identificação de peptídeos antimicrobianos. 2014. Trabalho de Conclusão de Curso (Bacharelado em Biotecnologia) – Faculdade de Ciências Biológicas e Ambientais, Universidade Federal da Grande Dourados, Dourados, MS, 2014.
Tipo de Acesso:	Acesso Aberto
URI:	http://repositorio.ufgd.edu.br/jspui/handle/prefix/4147
Data do documento:	12-Dez-2014
Aparece nas coleções:	Biotecnologia

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